被殻を明瞭に観察するためには，被殻内にある原形質や被殻外にある粘質の被覆を除去することが必要です。この有機物除去の過程をクリーニングと呼びます。クリーニングには幾つかの方法があります。ここでは代表的なものを紹介しましょう。

　　　　１．硫酸強熱法
　　　　２．硫酸−重クロム酸カリウム湯煎法
　　　　３．紫外線照射法
　　　　４．焼灼法
　　　　５．ブリーチ撹拌法
　　　　６．パイプユニッシュ法

１．硫酸強熱法

　珪藻の入っている懸濁液を試験管に深さ１ｃｍほど取り、２〜３倍量の濃硫酸を加える。懸濁液はなるべく水の量が少なくなるように一度静置させ沈澱したものを使うとよい。ドラフトの中でバーナーで１０分ほど加熱し、有機物がすべて炭化し暗褐色〜黒色の液になったら、すかさず硝酸カリウムを薬匙の小さい方で一杯入れる。するとジュッという音と共に炭素が二酸化炭素に変わり液が透明になる。これを冷やした後蒸留水で希釈し、珪藻殻の沈澱後上澄みを捨てる。再び蒸留水を加えこの作業を６〜７回繰り返し、完全に酸を取り除く。この方法は珪藻殻沈澱のために遠沈器を使うと比較的短時間で作業が終わるが、ドラフトが必要なことおよび、熱濃硫酸を扱うため注意が必要である。しかし，有機物を完全に除去でき，しかも硫酸に可溶の多くの無機物も除去できるため，昔から多くの研究者がこの方法，もしくはこれに類似する方法（硫酸の代わりに硝酸を用いる；硫酸処理の後，塩酸を加えて再加熱する；硝酸カリウムの代わりに過酸化水素水をもちいるなど）を用いている。

２．硫酸−重クロム酸カリウム湯煎法　　

　前出のクリーニング法と比べるともう少し穏やかな方法である。試験管に深さ１センチほど試料の懸濁液を取り、３〜５倍量の濃硫酸を加え湯煎にかける。３０分程たって硫酸が温まり懸濁液が茶色を帯びてきたところで重クロム酸カリウムを薬匙で１〜数杯入れる。薬品量は有機物の量により異なるが、まず１杯入れたら様子を見るのがよい。重クロム酸カリウム中の酸素が硫酸によって炭化された有機物と反応し二酸化炭素になり、液の色は重クロム酸カリウムの橙色ではなく暗緑色になるはずである。暗緑色であればさらに薬品を加える。もし液の色に若干でも黄色みが残っていたなら、それ以上薬品を入れる必要はなくそのまま１時間ほど湯煎を続けた後、蒸留水を加え酸を希釈し、沈澱後上澄みを捨てる。この操作を６〜７回繰り返す。薬品を数杯入れたにもかかわらず、液に黄色みがおきず、さらに薬品自体が完全に溶解せず沈澱してしまった場合も、１〜１．５時間ほど湯煎を続けてみるのがよい。この場合、時間が経ち、なお溶解しない薬品の沈澱があった場合も湯煎をやめ、蒸留水を加えて酸の希釈の過程に入ってよい。沈澱していた薬品が溶解し炭素と反応を続けるので、最終的にクリーニングは遂行されるはずである。この方法は時間がかかるが湯煎の間は湯の量だけ気をつけていれば、あとは放っておいて構わないので忙しい時などは意外と便利な方法である。この方法の難点はクロムを含む排水の処理にある。一般下水にクロムを含んだ排水を流してはいけない。大学など学内に有害廃棄物処理施設がないと、ちょっと無理な方法でもある。

３．紫外線照射法

　前記２つの方法は強酸を用いる方法であったが、こんどはそれを用いない方法である。これには強力紫外線ランプを持つ装置を使う。珪藻の入っている懸濁液を石英試験管に１ｃｃ入れ、３０％過酸化水素水を等量加える。石英試験管の口にアルミホイルで蓋をした後、紫外線分解装置に入れ１０分ほど紫外線を照射する。照射後、蒸留水を加え珪藻殻を沈澱させた後上澄みを捨てる。この操作を３回ほど繰り返す。この方法は最も短時間で殻の処理ができるほか、被殻の微細構造の破壊がほとんど無いため電子顕微鏡観察のためには最適である。ただ、多量の試料を一度に処理できない。また装置は市販品でないため自作あるいは業者に製作を注文しなければならない。

４．焼灼法

　以上３つの方法は殻のクリーニングに対し大変有効な方法である。しかしそれぞれ、ドラフト、排水処理、装置という点で誰もがどこでも使えるという方法ではない。そこで次にその点を解決できる方法を紹介する。ひとつは有機物を焼灼してしまう方法である。珪藻の生細胞の入っている低濃度の懸濁液をカバーガラスに滴下しそれを石綿金網に載せバーナーで焼く。有機物が炭化されて黒くなるが、さらに時間をかけ灰が白くなるまで焼く。焼く時間はケースバイケースであるが１０分〜３０分程度であろう。あまり短いと炭素が残り、火力を強くし過ぎるとカバーガラスが溶けたり曲がったりするので注意が必要である。

５．ブリーチ撹拌法

　もう一つの方法は家庭用のブリーチ（ＮａＣｌＯ：次亜塩素酸ナトリウムの漂白剤）を用いる方法である。１９９０年に南雲保と小林弘は走査型電顕観察のために一つの被殻の殻と帯片をそれぞれ外す方法を考案した。これにはブリーチが使われ、材料の珪藻被殻は顕微鏡下で取り扱われた。この方法はたいへん優れた方法で筆者も珪藻の電顕試料作成では大いに利用している。この方法を参考に試験管あるいはビーカーの中で大量の珪藻殻をクリーニングすることを工夫してみたので、ここにそれを紹介したい。まず採集した試料と５０％に薄めた家庭用ブリーチが１：５になるように容器の中に入れる。２分たったら充分に強く撹拌する。これは被殻の中から原形質を外に出し被殻自体を殻と帯片に分けるためである。その後できるだけ頻繁に撹拌を行い３０分たったら蒸留水を加え沈澱させる。時間があれば何回か撹拌しながら１，２日間放置し、その後、蒸留水を加え沈澱させる。このようにすると被殻の外にでた葉緑体がさらに細かく分解し、より良好な結果が得られる。いずれにせよ沈澱が得られたなら、上澄みを捨て再び蒸留水を加える。これを６〜７回繰り返す。この方法は火も強酸も使わない方法であり、薬品も家庭用ブリーチと誰にでも手に入る品物でありとても簡便である。最近の家庭用ブリーチには界面活性剤の入っているものがあるが、これは撹拌の時に泡が立ってしまい具合が悪いので、入っていないものを用意することが必要である。この方法はあくまでも珪藻殻クリーニングの簡便法であって研究用ではない。殻の中から有機物はなくなるが、それが殻の外に散らばってしまうからである。しかし有機物はかなりの小粒子に分解され、蒸留水で希釈中に上澄みと一緒に排除されていくため、思ったよりきれいなプレパラートができあがる。

６．パイプユニッシュ法

　最も新しく考案された，ブリーチ法より，さらに強力かつ簡便な方法である。パイプユニッシュの成分はブリーチに水酸化ナトリウム4%と界面活性剤を加えたに過ぎないのであるが，有機物（特にタンパク質）をよく溶かす。界面活性剤が入っている割には，界面活性剤入りのブリーチと比べ，あまり泡が立たないため使いやすい。詳しい方法はここをクリック。

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